科学出版社由中国科学院编译局与30年代创建的有较大影响的龙门联合书局于1954年8月合并成立。1993年8月恢复使用“龙门书局”副牌。2007年4月转制成为科学出版社有限责任公司。2011年7月，中国科技出版传媒股份有限公司以科学出版社有限责任公司为基础成立，是中国科技出版传媒集团的核心企业，科学出版社是中国科技出版传媒股份公司的核心出版品牌。

科学出版社是中国最大的综合性科技出版机构。在国内拥有完善的出版、发行网络，下设上海分公司、武汉分公司和成都公司，以及纽约公司、东京公司等19家分、子公司。同时与十几个国家和地区的100多家出版公司建立了长期的良好合作关系。